Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBAG9O00559 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms