Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HACD1B0YJ81 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms