Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NEMP2A6NFY4 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms