Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms