Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRAF6Q9Y4K3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms