Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH7Q9ULB5 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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