Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms