Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFMBT1Q9UHJ3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms