Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPARGC1AQ9UBK2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms