Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CCDC88CQ9P219 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CCDC88CQ9P219 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCDC88CQ9P219 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CCDC88CQ9P219 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CCDC88CQ9P219 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CCDC88CQ9P219 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CCDC88CQ9P219 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CCDC88CQ9P219 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CCDC88CQ9P219 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCDC88CQ9P219 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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