Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMPRSS4Q9NRS4 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms