Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRDM12Q9H4Q4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms