Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NYXQ9GZU5 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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