Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP74Q9C0B2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP74Q9C0B2 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms