Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM54Q9BYV2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM54Q9BYV2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms