Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011525.2-202ENST00000590611 1657 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL356259.1-201ENST00000443554 1059 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 GK-AS1-201ENST00000464659 651 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR7E121P-201ENST00000494533 1022 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC021820.1-201ENST00000525564 808 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF738-203ENST00000594245 1086 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 MND1-206ENST00000622785 830 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC239585.2-202ENST00000624629 434 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms