Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 TNKS-213ENST00000522110 2900 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 CNTROB-203ENST00000565740 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 PIGO-202ENST00000361778 2464 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 TP53I11-203ENST00000395648 3381 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 APOL3-205ENST00000397293 2214 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 SZRD1-201ENST00000401088 3636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 SLC39A13-204ENST00000524928 3553 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 SLC27A6-203ENST00000506176 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 AC008758.4-201ENST00000435033 2593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 CTCFL-217ENST00000608425 2915 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 ATG13-211ENST00000528494 2351 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 PLAU-201ENST00000372764 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 PDP1-202ENST00000396200 4358 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SNHG12Q9BXW3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms