Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SALL3Q9BXA9 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SALL3Q9BXA9 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms