Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SSBP4Q9BWG4 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms