Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PKP4Q99569 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms