Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VAT1Q99536 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms