Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NOTCH4Q99466 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms