Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RPS6KC1Q96S38 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPS6KC1Q96S38 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms