Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LINC00526Q96FQ7 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LINC00526Q96FQ7 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms