Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC1Q96C34 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms