Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLDN23Q96B33 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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CLDN23Q96B33 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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CLDN23Q96B33 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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CLDN23Q96B33 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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CLDN23Q96B33 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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CLDN23Q96B33 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN23Q96B33 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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