Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCAMP4Q969E2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCAMP4Q969E2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms