Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHMTQ93088 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms