Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRG4Q92954 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms