Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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CSNK2A3Q8NEV1 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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CSNK2A3Q8NEV1 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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CSNK2A3Q8NEV1 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CSNK2A3Q8NEV1 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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