Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms