Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALYREFQ86V81 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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