Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms