Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3D4

LYSMD3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD3Q7Z3D4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYSMD3Q7Z3D4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms