Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
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USP31Q70CQ4 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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USP31Q70CQ4 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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USP31Q70CQ4 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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USP31Q70CQ4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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USP31Q70CQ4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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USP31Q70CQ4 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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USP31Q70CQ4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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USP31Q70CQ4 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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USP31Q70CQ4 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
USP31Q70CQ4 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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