Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL17Q6UXB2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL17Q6UXB2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL17Q6UXB2 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL17Q6UXB2 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL17Q6UXB2 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL17Q6UXB2 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL17Q6UXB2 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL17Q6UXB2 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL17Q6UXB2 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL17Q6UXB2 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL17Q6UXB2 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL17Q6UXB2 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL17Q6UXB2 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL17Q6UXB2 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL17Q6UXB2 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL17Q6UXB2 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL17Q6UXB2 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL17Q6UXB2 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL17Q6UXB2 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL17Q6UXB2 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL17Q6UXB2 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL17Q6UXB2 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL17Q6UXB2 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL17Q6UXB2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL17Q6UXB2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL17Q6UXB2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL17Q6UXB2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL17Q6UXB2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CXCL17Q6UXB2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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CXCL17Q6UXB2 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CXCL17Q6UXB2 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CXCL17Q6UXB2 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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