Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ANKRD54Q6NXT1 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ANKRD54Q6NXT1 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms