Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ANKRD40Q6AI12 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms