Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LDLRAP1Q5SW96 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms