Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SFT2D3Q587I9 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SFT2D3Q587I9 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms