Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
KLHL12Q53G59 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms