Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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SP6Q3SY56 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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SP6Q3SY56 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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SP6Q3SY56 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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SP6Q3SY56 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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SP6Q3SY56 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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SP6Q3SY56 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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SP6Q3SY56 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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SP6Q3SY56 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SP6Q3SY56 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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