Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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