Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RTN1Q16799 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RTN1Q16799 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms