Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms