Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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ZNF239Q16600 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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ZNF239Q16600 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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ZNF239Q16600 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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ZNF239Q16600 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ZNF239Q16600 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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