Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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