Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC18A3Q16572 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms