Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SNAPC1Q16533 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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