Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC6Q16204 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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